2023年度（令和5年度）第25回ABiS電子顕微鏡トレーニング 開催概要 「SEMアレイトモグラフィー ～初心者編～」

2024年1月24日（水）〜 1月25日（木）

兵庫県立大学　播磨理学キャンパス　研究2期棟
〒678-1205　兵庫県赤穂郡上郡町光都3-1-2

※JR山陽線/山陽新幹線・相生駅南口よりウイング神姫「SPring-8」行きのバスに乗車。
「県立大理学部前」（約22分）バス停にて下車。徒歩3分。

相生駅－スプリング８バス時刻表20231001

　本トレーニングは、SEMアレイトモグラフィーのための連続リボン状超薄切片作製から、SEMによる画像取得、および三次元構造の再構成まで、一貫して行います。今回は、初心者を対象としてトレーニングを行います。     
　SEMアレイトモグラフィーにより高解像度で定量的な解析を行うためには、正しい順序で整列した超薄切片を安定して作製することが不可欠で、この連続超薄切片の成否が最も重要なポイントとなります。新方式のウルトラミクロトームARTOS 3Dは、三次元再構成に必要な何百枚もの超薄切片を、連続したリボン状に自動的に作製し、SEM観察用基板へ直接回収するシステムです。切削プロセスの自動化により、これまで必須とされた高難度の手作業が大幅に削減され、試料作製にかかる時間も短縮できます。　
　基板上に回収した連続超薄切片を自動撮影システムによりSEMで観察し、試料の連続断層画像を取得します。この一連の連続断層画像セットを専用ソフトウエアに取り込み、画像の自動整列とアライメント調整、ならびに解析する試料領域の選択などを行い、連続断層画像を積み重ねることにより三次元構造を再構成します。必要に応じて、試料の観察対象となる構造体のセグメンテーションやカラーリングを行います。　
　また、本トレーニングで扱うSEMアレイトモグラフィーの他に、超薄切片の電子顕微鏡画像からの三次元再構成法にはTEMトモグラフィーがあります。それぞれSEMとTEMを使用した2つのトモグラフィーの違いや特徴などについても、確認したいと考えています。

主な装置
　・ARTOS 3D （ライカマイクロシステムズ）
　・EM TRIM （ライカマイクロシステムズ）
　・走査電子顕微鏡JSM-IT800 （日本電子）
　・親水化処理装置IB-3 （エイコー）　

SEM観察・三次元再構成に使用するソフトウエア
　・SEM Supporter （システムインフロンティア）：SEM観察・連続断層画像取得
　・Stack ’n' Viz （システムインフロンティア）：連続断層画像の三次元再構成・可視化
　・Colorist （システムインフロンティア）：セグメンテーションおよびカラーリングによる解析

1月24日（水）    

　            9:50                        受付開始（相生駅前9:10発または9:45発のバスをご利用ください）
　            10:20～10:30       朝礼
　            10:30～11:30　  講義「樹脂包埋と超薄切削の基礎」
                                                  講師：伊藤喜子・ライカマイクロシステムズ株式会社
                11:30～13:00　   実習（１）ウルトラミクロトームによる超薄切片作製法
　　   ＜13:00～14:00       昼休み＞
　            14:00～16:30       実習（２）ARTOS 3Dを用いたリボン状超薄切片作製
　            16:30～17:00      まとめ・質疑応答

1月25日（木）             

　            9:50                       受付開始（相生駅前9:10発または9:45発のバスをご利用ください）
　            10:20～10:30      朝礼
　            10:30～12:00      講義「TEM Tomography&SEM ArrayTomography」
                                                 講師：古河弘光・株式会社システムインフロンティア
            ＜12:00～13:00      昼休み＞
　            13:00～16:30      実習（３）連続切片画像の取得から三次元再構成
　            16:30～17:00      まとめ・質疑応答

※トレーニングは2日間のコースとなっていますが、ご都合により午前または午後だけの参加や1日間だけの参加でも問題ありません。その場合、備考欄に参加日時を明記して下さい。

伊藤喜子（ライカマイクロシステムズ株式会社）
古河弘光 ・清水美代子・中小原順一（株式会社システムインフロンティア）
西野有里 ・ 宮澤淳夫（兵庫県立大学 大学院理学研究科）

学術変革領域研究（学術研究支援基盤形成）先端バイオイメージング支援プラットフォーム
公益社団法人日本顕微鏡学会　生体解析分科会
株式会社システムインフロンティア
ライカマイクロシステムズ株式会社
兵庫県立大学　大学院理学研究科

10名（科研費採択者またはその関係者5名程度を含む）

ウルトラミクロトームによる連続リボン状超薄切片の作製を学びたい方
SEMアレイトモグラフィー、TEMトモグラフィーなどの三次元構造の再構成に興味のある方
研究・開発・評価などの仕事で電子顕微鏡法に従事される方

日本顕微鏡学会・会員：10,000円（会員は不課税）
日本顕微鏡学会・非会員：11,000円（非会員は税込み）

※トレーニング会場受付にて現金でお支払いください。（日本顕微鏡学会の領収書をお渡しいたします）
※ 科研費採択者の関係者（学生）は無料となる場合がありますので、申し込み時にご連絡ください。

2024年（令和6年） 1月15日（月）

下部にある「■お申し込み」より必要事項をご入力ください。

※本トレーニングへの申込時に役職の明記をお願いします。学生の場合は役職欄に学年の記載をお願いします。

※科研費採択者および関係者は、お申し込みの際に備考欄に下記について記入をお願いします。
　●科研費採択情報（種目、課題名、研究期間、研究代表者）
　●ご自身が科研費に採択されていないポスドク・大学院生等は、指導教員の科研費採択情報

　※申し込み後、トレーニングに関する電話連絡をすることがあります。
　※定員になり次第、締め切りとなりますのでご了承ください。
　※トレーニングの様子を撮影することがありますので予めご了承ください。